Backofen auf 180° C Unter- und Oberhitze vorheizen. Eine kleine Auflaufform (0,7 l) mit Öl/ Butter einfetten.
Tomaten waschen und in die Auflaufform geben. Sie sollten den Boden der Form bedecken.
Zwiebel schälen und in Streifen schneiden. Über die Tomaten verteilen. Den Käse zerbröckeln und in die Form verstreuen. Thymian und Salbei ebenfalls in die Form bestreuen.
In eine Rührschüssel Mehl, Zucker und Salz vermengen. Die Eier dazugeben und mit einer Gabel verquirlen. Nach und nach die Milch untermischen und zu einem glatten Teig verarbeiten. Den Teig in die Form gießen.
Für 55 Minuten backen, bis der Teig goldbraun und fest ist.
Tomaten Clafoutis aus dem Ofen nehmen, 5 Minuten ruhen lassen und servieren.